Analisis y Mejora de un Proyecto de Control de Inventario entre Sucursales

Buenas tardes!
Gracias por el tiempo de antemano. Tengo un proyecto avanzado sobre un sistema web de control de ventas, compras y traspasos entre sucursales. Está desarrollado en PHP, JavaScript, Ajax, Bootstrap y con base de datos en MySql.




Tengo un problema en el código con el control de inventario (entradas, salidas y traspasos). Necesito que se pueda hacer un análisis del código actual (específicamente de la parte del control de inventario) y se pueda mejorar o cambiar el código para que el sistema funcione correctamente.

Se dará preferencia a las personas que tengan conocimiento en sistemas de control de inventario entre sucursales.

El problema que tengo ocurre en la suma y resta del stock del producto por sucursal: Cuando eliminamos una compra que no es la última registrada. También hay problema al eliminar una venta y Cuando se registra y elimina un traspaso. El problema es que para hacer el control de inventario actualmente se usa la tabla DetalleIngreso que es parte de Compras.
En el documento le explico una posible solución manteniendo lo que ya esta desarrollado. Pero estamos abiertos a que se pueda rehacer el código de la parte del control de inventario  de acuerdo a lo más conveniente.

Aspectos a tomar: Por favor revisar el documento adjunto