Migração de sites

Boa noite, tenho 3 sites hospedados na Locaweb. Porém os sites estão em um servidor antigo (Windows 2003). E para atualizar os sites (estão em wordpress), preciso mudar de servidor.

Pensei nessa mudança em aproveitar e mudar de empresa. Ir para a Hostgator, pois tenho uma experiência melhor com eles (suporte) e ainda oferecem um pacote bem mais em conta.
Assim, gostaria de um profissional que esteja habilitado pra fazer essa migração.
Eu conversei com a Hostgator e eles me disseram que o pacote compartilhado é todo em Linux. Como meu site está hospedado em windows, você acha que eu teria algum problema na migração? Quanto você cobra? Ainda tenho 40 emails das 3 empresas. Mas eles estão todos no outlook, conf.
Via pop.
No pacote que eu quero contratar eles fazem a migração de um site, mas outros dois não. Me orientaram fazer a migração dos sites via ftp.