Aplicación Ecommerce Android y Ios

Aplicación para Android y IOS (no se si nativa o no la verdad que no entiendo bien que diferencia hay entre ambas)
Registro de clientes en linea
Aceptar pagos por medio de Mercado Pago

El proyecto esta en tapa de IDEA por lo cual no cuento con diseños y me gustaría encarar todo con un solo punto de contacto, para avanzar en diseño y programación.

Básicamente lo que necesito es una aplicación para comercio electrónico con alta de clientes en linea ya que uno de los atributos de los clientes al dar el alta dispara opciones de productos según lo que cargan ahí.
Esta orientada a productos escolares, por lo cual tendremos convenios con diferentes colegios y el colegio sera el atributo que permitirá mostrar productos en particular para ese cliente.
Los colegios que tengamos convenios tendrán un % de descuento sobre los productos x% por lo cual se tiene que poder administrar este descuento para que muestre información según corresponda.

Esto no implica que los colegios que no tengan convenio o las personas que no estén registradas no puedan comprar, pero lo harán con precios normales sin descuento.

Contamos con un hosting (towebs) y dominio registrado para la administración del back end. Se pueden instalar en el mismo distintas herramientas disponibles para el manejo de los productos y demás particularidades.  (Presta shop - magento - y otros de administración de contenido)

Somos unos emprendedores con experiencia en este rubro pero no somos una gran empresa ni tampoco contamos con un presupuesto ilimitado.
  Queremos desarrollar nuestra idea para poder seguir generando nuevos desarrollo a futuro web de ecommerce tanto para esta línea como para otro emprendimiento que tenemos, pero ahora comenzamos con esto para ver como nos resulta esta forma de contratación o ver como podemos seguir avanzando.